Publicaciones Iliana Del Rocío Alcocer Negrete

Caracterización De La Región Variable De Integrones Clase 1 En Aislados Clínicos De Klebsiella Pneumoniae Resistentes A Carbapenemes.
REVISTA
REVISTA ECUATORIANA DE MEDICINA Y CIENCIAS BIOLÓGICAS (REMCB)

Publicación
2016-08-26
Los integrones son estructuras observadas con frecuencia en bacilos Gram negativos, especialmente entre los miembros de la familia Enterobacteriaceae. Se estudió la presencia de integrones clase 1 y su relación con la resistencia bacteriana. La presencia de integrones fue estudiada por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación. Se analizaron treinta aislados resistentes a carbapenemes de Klebsiella pneumoniae que fueron positivos para el gen de la integrasa 1 (intI1). En veintiseis de estos aislados se amplificaron regiones variables de alrededor de 2 000 pares de bases. El patrón común de genes obtenidos mediante el análisis de estas regiones fue (dfrA12 - orfF - aadA2). La presencia de estas plataformas que promueven la diversidad genética provee a las bacterias de resistencia a una amplia gama de antibióticos. La alta prevalencia de integrones observadas entre estos aislados funciona como fuente de difusión de determinantes de resistencia.

Characterization Of A Small Outbreak Of Salmonella Enterica Serovar Infantis That Harbour Ctx-M-65 In Ecuador.
REVISTA
BRAZILIAN JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES

Publicación
2016-07-01
Travellers’ diarrhoea (TD) is the foremost health problem contracted abroad by United States citizens, affecting between 20% and 60% of those travelling to developing countries (www.cdc.gov). The aim of this study was to report the first Salmonella spp. resistant to broad spectrum antibiotics reported in Ecuador. Identification and sensitivity profile were performed using VITEK2® compact (bioMérieux, USA). Serotype was confirmed by agglutination in the National Reference Laboratory, INSPI, Quito, Ecuador. Plasmid extraction was performed following the manufacturer’s instructions (Pure Yield Plasmid Miniprep System, Promega, United Kingdom). ERIC-PCR was performed following the conditions previously described.1 The PCR for amplification of the CTX-M gene was performed as previously described.2 Purification of the PCR amplification from the agarose gel was performed following the manufacturer’s instructions (Wizard® SV Gel and PCR Clean-Up System, Promega) and sequenced in Macrogen, South Korea. From a total of 28 strains of Salmonella spp. isolated in the laboratory (January 2014–July 2015), five isolates were of the same clone which presented high resistance to antibiotics. The identification and serotyping showed that the strain cor- responded to Salmonella enterica serovar Infantis harbouring CTX-M-65. ERIC-PCR confirmed the isolates were of the same clone (Fig. 1). This is the first time a CTX-M 65 has been found outside of Asia, highlighting the importance of a good antibiotic policy in all countries as resistance can be easily disseminated around the world due to travel and trade.

Diseminación clonal de Kpc-2 en Klebsiella Pneumoniae resistente a carbapenémicos
REVISTA
INFECTIO

Publicación
2020-01-24
Objetivo: Determinar los mecanismos de resistencia antibiótica y la epidemiología molecular de aislados clínicos de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenémicos. Materiales y métodos: 30 aislados multirresistentes de K. pneumoniae fueron obtenidos a partir de: urocultivo, aspirado traqueal, secreción de herida, sonda vesical, hemocultivo, líquido peritoneal, punta de catéter, colección abdominal y secreción bronquial. Los aislados fueron colectados de noviembre de 2012 a abril de 2013. La identificación y susceptibilidad antibiótica fue determinada por el sistema automatizado VITEK 2. Para la amplificación de genes de resistencia se empleó PCR, la determinación de las Secuencias Tipo (ST) fue obtenida por tipificación multilocus de secuencias (MLST) y la relación clonal fue establecida por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE). Resultados: Todos los aislados mostraron fenotipos multirresistentes, excepto a colistina y tigeciclina. El 100% de los aislados fue productor de la carbapenemasa KPC- 2. La determinación de la presencia de genes codificantes de β-lactamasas de Espectro Extendido mostró que el 67% de los aislados fue positivo para el gen blaCTX-M, el 100% fue positivo para el gen blaSHV y 93% fue positivo para el gen blaTEM. El análisis de la relación clonal de los 30 aislados agrupó a 20 en un mismo pulso tipo. El análisis por MLST demostró que la ST predominante fue ST258 presente en el 60% de la población, seguida de ST1199 presente en el 20% de la población analizada. Conclusiones: Los resultados obtenidos demuestran la importancia de implementar y combinar estudios pidemiológicos, clínicos y moleculares para comprender la distribución de la resistencia entre bacterias de interés clínico.

Genetic diversity and drug resistance of mycobacterium tuberculosis in Ecuador
REVISTA
INTERNATIONAL JOURNAL OF TUBERCULOSIS AND LUNG DISEASE

Publicación
2019-02-01
BACKGROUND: The genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis in Quito, Ecuador is not well nown. OBJECTIVE : To investigate mutations related to drug resistance and bacterial genotypes in M. tuberculosis strains in Ecuador. DESIGN: This was a retrospective study of M. tuberculosis isolates from 104 patients. Isolates were phenotypically resistant to rifampicin (RMP) and/or isoniazid (INH). The genotype was determined using 24-locus mycobacterial interspersed repetitive units-variablenumber tandem repeats (MIRU-VNTR). RESULT S : Isolates showed mutations in the rpoB and katG genes, and the inhA promoter. In rpoB, we found 13 genetic alterations at codons 511, 513, 514, 515, 516, 526 and 531. Forty-six (44.2%) RMP-resistant isolates belonged to codon 531. In katG, there were nine genetic alterations at codons 296, 312, 314, 315, 322, 324 and 351. Fifty-three (51%) INH-resistant isolates belonged to codon 315. Five mutations not previously described were identified in katG: Thr324Ser, Thr314Ala, Ala312Pro, Trp351Stop and deleted G at 296 codon. The Latin American Mediterranean (LAM) (33.7%) and Ghana (30.8%) lineages presented most of the main mutations observed. CONCLUS ION: This is the first report from Ecuador; it describes five new mutations in katG and indicates that LAM is the most prevalent lineage.